Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc130Q9D516 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266.3 ms