Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms