Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931423N10RikQ9D4J9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931423N10RikQ9D4J9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms