Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gcc1Q9D4H2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcc1Q9D4H2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms