Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syce1Q9D495 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms