Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsig1Q9D2J4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vsig1Q9D2J4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms