Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snapc3Q9D2C9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snapc3Q9D2C9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms