Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Creb3l4Q9D2A5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms