Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D1F3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D1F3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms