Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1lQ9D1E5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms