Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tspan11Q9D1D1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms