Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms