Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem88Q9D0N8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms