Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Exosc7Q9D0M0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms