Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ssu72Q9CY97 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ssu72Q9CY97 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms