Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube2fQ9CY34 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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