Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sycp2Q9CUU3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sycp2Q9CUU3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms