Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smc1aQ9CU62 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms