Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms