Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CR55 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CR55 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CR55 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CR55 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR55 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR55 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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