Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ifitm3Q9CQW9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ifitm3Q9CQW9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ifitm3Q9CQW9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ifitm3Q9CQW9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ifitm3Q9CQW9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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