Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rer1Q9CQU3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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