Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atp6v0e1Q9CQD8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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