Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NepnQ9CQ76 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NepnQ9CQ76 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NepnQ9CQ76 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NepnQ9CQ76 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NepnQ9CQ76 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms