Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf17Q99MV7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf17Q99MV7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms