Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprtQ99M80 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprtQ99M80 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms