Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms