Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf2Q99LE6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcf2Q99LE6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms