Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmp1Q99KU0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmp1Q99KU0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms