Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PpifQ99KR7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms