Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tspan1Q99J59 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms