Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp3Q91W36 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms