Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nsmce2Q91VT1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsmce2Q91VT1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms