Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NifkQ91VE6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms