Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Paip1Q8VE62 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms