Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc92Q8VDN4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms