Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fyco1Q8VDC1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fyco1Q8VDC1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fyco1Q8VDC1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms