Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgtbQ8VD33 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtbQ8VD33 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtbQ8VD33 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtbQ8VD33 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtbQ8VD33 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtbQ8VD33 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtbQ8VD33 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtbQ8VD33 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtbQ8VD33 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SgtbQ8VD33 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms