Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn4Q8VCH8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms