Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg10Q8R1P4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg10Q8R1P4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms