Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Treml1Q8K558 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms