Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ltbp4Q8K4G1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ltbp4Q8K4G1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms