Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OptnQ8K3K8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.33■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.33■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
OptnQ8K3K8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms