Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap2Q8K389 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap2Q8K389 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms