Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700001C19RikQ8K168 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700001C19RikQ8K168 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms