Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot3Q8K0V4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot3Q8K0V4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms