Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf628Q8CJ78 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms