Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trip10Q8CJ53 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trip10Q8CJ53 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms