Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Aldh4a1Q8CHT0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aldh4a1Q8CHT0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms