Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Upp2Q8CGR7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms